整肠生这个药物可以长期的服用，但是最好要看患者是什么疾病，大多数疾病并不需要长期的口服整肠生。
如果患者短期内有腹泻、肠道功能紊乱这样的表现，可以短期口服整肠生。如果患者是比较严重的炎症性肠病，比如溃疡性结肠炎，这样患者可能在相当一段时间以内出现肠道菌群失调，这时候口服整肠生的时间可以适当的延长。一般情况下，口服一两个月甚至更长的时间也是允许的。
整肠生这个药物副作用比较少，相对比较安全。
