支原体和细菌的主要区别在于病源结构不同，治疗方法不同，导致的症状也不同。
支原体分为人型支原体和解脲支原体两种，女性的支原体性阴道炎，最主要的是解脲支原体感染。容易导致阴道黄色分泌物，外阴瘙痒。长时间感染有可能向上引起输卵管炎和子宫内膜炎，长时间的慢性输卵管炎也可以导致不孕和输卵管阻塞。
而细菌性阴道炎常见的有加德纳杆菌、大肠杆菌、金葡菌阳性感染，可以导致稀薄的阴道分泌物量多和外阴瘙痒。在治疗方面，主要是使用甲硝唑来治疗。
