纤维支气管镜全麻检查相对安全，但技术操作不当，可能会导致以下并发症：喉气管和支气管痉挛。
主要是由于麻醉不足，声门打开不充分，和内窥镜强行通过引起的。出血是最常见的并发症，一般来说，血容量不大，可以自行停止。偶尔会有大量出血，甚至窒息，危及生命。纤维支气管镜可以根据肺部影像学检查，进行明确诊断。活检、刷检和灌洗是纤维支气管镜三种基础取材方法。根据镜下所见，选择合适的取材方法，得到准确检查结果是内镜医生的必备技能。
