怀孕胚胎不发育原因有很多：
首先，可能与胚胎自身发育异常有关，比如说胚胎染色体发育的异常，可能出现胚胎停止发育。
其次，还有母体的一些因素有关，比如说母亲还有一些并发症，最常见的包括一些风湿免疫系统的疾病，比如说系统性红斑狼疮、抗磷脂抗体综合症等都可能造成胚胎停止发育。一旦出现胚胎停止发育，需要查明原因，对于下次妊娠具有很好的指导意义。
