先天性食管闭锁共分为五型,第一型食管上下两段不连续形成盲端。第二型食管的上段与气管相通,下端是盲端。第三种是食管的上端是盲端,下端与气管相通。第三型又分为3a和3b两型。3A型是上端与下端的距离超过两个厘米,3b型是食管的上段与下段小于两厘米。一般来说3b型相较3a型预后更好。第四型是食管的上下两端分别与气管相通。第五型是本身没有食管闭锁,但是食管与气管之间有瘘管相通又称为h型。