复方黄连素作为一种中成药，副作用相对较小。常见的不良反应有恶心、呕吐、过敏性皮疹或者出现药物性发热等。一般这些症状在停药之后会逐渐消失。而复方黄连素主要的临床应用为清热燥湿，行气止痛，止泻止痢。主要用于治疗泄泻，大肠湿热，赤白下痢，里急后重或暴注下泻，肛门灼热，肠炎等等。复方黄连素的主要成分包括盐酸小檗碱、木香、吴茱萸和白芍。服药期间一定要戒烟戒酒，少吃辛辣刺激性食物。
