半夜三更胃疼,可能会存在胃或十二指肠溃疡的可能,可以有反酸,烧心,腹痛的临床症状,进食食物后,胃疼症状会得到缓解,检查手段需进行胃镜检查,明确胃十二指肠病变后给予相应处理,另建议完善碳13或碳14呼气实验,观察有无幽门螺旋杆菌感染,如存在细菌感染,则建议进行抗菌治疗,方案为四联药物口服14天疗程。停药一月后复查呼气实验,观察抗菌疗效,如幽门螺旋杆菌未得到较好杀灭,可能需要二次杀菌。