非离子碘造影剂的副作用主要是容易引起身体出现不良反应，就是过敏反应。
轻度的过敏反应是面部潮红、头痛、恶心、轻度呕吐、轻度荨麻疹。中度的过敏反应是面部水肿、严重呕吐、较重荨麻疹、轻度喉头水肿或者支气管痉挛等。重度的过敏反应是严重的喉头水肿或者支气管痉挛、惊厥、昏迷、休克等。肾脏功能差的患者注射造影剂，有可能会加重肾脏的损害。所以注射过造影剂检查完后，建议患者多喝水，这样有助于造影剂的排除。
