吗叮啉和莫沙必利的区别主要是在于下面几点：第一、作用的机理不同。第二、临床的治疗效果不好。吗叮啉可直接阻断胃肠道的多D2受体而发挥促进胃动力的作用。莫沙比利主要是选择性5羟色胺4受体激动药，能促进乙酰胆碱的释放，刺激胃肠道的蠕动，发挥作用。另外，在治疗效果上，吗丁啉主要是促进食管胃的蠕动，增加胃动力。而莫沙比利，全消化道的促胃动力药，用于功能性消化不良。
