无痛肠镜检查后，若患者出现严重腹胀、腹痛、且肠鸣音消失，应考虑肠壁穿孔的可能，及时前往医院急诊治疗，肠穿孔可能与患者在麻醉状态下，对于腹胀、腹痛缺乏应急性反应和医生操作等因素相关。
检查后可能出现头晕，但多数患者5~20分钟可以缓解，如头晕持续不缓解，可及时告知医生。如取病理活检或息肉切除的患者，术后可以有大便少量带血的情况，一般无需特殊处理。但如果出现剧烈腹痛、发热、大量出血，需及时返回进行检查和治疗。
