磁共振检查本身作为一种相对安全的检查手段，很少会对人体产生伤害，但是有一些相对禁忌症和禁忌症。
如果人体内有植入金属如钢板钢钉，心脏支架等等，应首先了解植入物材质后谨慎选择该检查，以免产生不良反应。其次，心脏起搏器植入和胰岛素泵的患者不能做磁共振检查，因为磁场会导致器材失灵。还有一些患者有幽闭恐惧症，做该检查时会产生极度的不适症状，所以也不能做该检查。
