艾灸对人体的副作用，主要有过敏和烫伤两种。
对于艾灸出现了过敏反应，主要与艾条有关。如果艾条中选用的艾叶或者艾绒质量比较差，对于过敏体质的人，吸入艾叶燃烧时产生的烟，接触艾叶燃烧后的灰烬，都会引起过敏。主要表现为头昏头痛，皮肤瘙痒，皮肤斑丘疹，咳嗽，恶心等呼吸道，胃肠道以及皮肤的过敏反应。对于这类人群，建议选用优质艾叶制作的艾条。另一项副作用主要是烫伤，这与艾条艾灸时距离皮肤过近，艾灸时间过长有关系。
