临床上能够引起高烧41摄氏度的原因有很多，主要根据是否有病原体感染分为感染性发热和非感染性发热，其中以感染性发热较为常见，能够引起感染性发热常见的病原体包括细菌、病毒、支原体、衣原体、真菌、寄生虫等；能够引起非感染性发热常见的原因包括无菌性坏死物质的吸收、体温调节中枢的异常、自主神经功能紊乱、内分泌或代谢障碍、抗原抗体反应等，根据检查结果才能够明确病因，然后再给予对症治疗。
