妇科支原体感染常用的药物包括抗生素类，常用四环素类，其中有四环素或盐酸多西环素或米诺环素。其他抗生素类常用的有大环内酯类，如红霉素或阿奇霉素。支原体感染后，也可以直接取分泌物做药敏试验，找到敏感的抗生素直接对症治疗。
在治疗的过程中，性伴侣也应该接受，同时治疗，疗程结束后一周复查，治愈的标准是症状全部消失，无尿道分泌物、尿沉渣涂白细胞，属正常，取尿道分泌物，查支原体为阴性。
