跑步腰两侧疼痛，考虑以下几点方面原因：
第一点，考虑是久坐引起的腰肌劳损，这种情况下，多与患者久坐有关，建议避免久坐弯腰搬重物，同时可以运用外用理疗药物进行治疗，必要时可以考虑局部的痛点封闭进行治疗，一般问题不大。
第二点，多考虑是肾结石所引起的相关症状，这种情况下，建议行x线片检查、泌尿系超声检查、尿常规检查，明确相关诊断。一般来说，嘱患者多饮水，改善患者生活方式，看看相关改善是否可以将结石排出，必要时考虑进行手术治疗。
