不宁腿综合症造成的原因可以分为继发性的和原发性的。
继发性的不宁腿，原因非常多，包括脊髓小脑共济失调、腓骨肌萎缩症、帕金森病、尿毒症、缺铁性贫血、妊娠等。而原发性的不宁腿可能与遗传疾病有关，具体的原因可能不是十分清楚，目前为止有可能是由于中枢神经系统的兴奋性，氨基酸兴奋作用导致，也有可能是由于铁的缺乏引起的，还有可能是由于家族有遗传史，呈现的染色体显性遗传而引起。
