儿童做脑部CT的危害，主要是辐射带来的损伤。但是这种损伤是在反复多次，短期内进行的，CT才会产生，如果偶尔做一次到两次，它的辐射剂量是在安全范围内的。
辐射造成的损伤主要是包括白细胞降低。消化功能的减弱。眼部的损伤，以及诱发肿瘤的发生。做一次脑部CT辐射量约为两毫西弗。它还是处于非常安全的剂量范围内的，而且头部CT是一些其他的检查作用，无法替代的。所以在临床上在必要时，医生会建议儿童做头部CT来明确一些疾病的诊断。
