生殖道支原体感染，男性的症状主要包括尿道口红肿、分泌物稀薄、量少，呈浆液性或脓性。严重者可伴有阴部的膨胀性疼痛、腰酸、双股内侧不适感。如未经及时治疗者，也可引起精囊炎、附睾炎、前列腺炎。
女性的主要症状有尿道炎，但症状不明显，而有宫颈炎的表现。主要为宫颈口红肿，有少量稀薄的分泌物，一般有30%到40%的男性，和80%到90%的女性，无自觉症状或症状很轻，未能引起患者的注意。
