单纯宫颈HPV病毒39阳性并不严重，首先需要进行进一步的宫颈液基细胞学检查。如果液基细胞学检查没有任何异常，这样就提示单纯的病毒感染，病毒感染有自愈性，大概在2到3年，有可能会自动消退。如果持续感染的情况下，会导致宫颈病变，所以需要定期检查。
宫颈液基细胞学检查有异常的情况下，这样就考虑宫颈有病变的可能，需要进一步在阴道镜下进行宫颈活检，明确宫颈组织的情况，根据宫颈组织病理结果进行下一步治疗，是观察或者是手术治疗。
