两者的功效是不相同的。
其中当归属于补血类要药，味甘、辛，性温。归入肝经、心经和脾经，适用于血虚症，代表方剂有四物汤、八珍汤、桃红四物汤、胶艾汤、当归四逆汤、济川煎等，中医辨证属湿盛中满，拉肚子的人应慎用当归。
黄芪属于补气类要药，味甘，性微温，归入脾经和肺经，适用于气虚症，代表方剂有补中益气汤、玉屏风散、透脓散、内补黄芪汤、黄芪桂枝五物汤等，妊娠晚期应慎用黄芪，易引起流产。
