临床上引起肌酐降低的疾病很多，比如进行性肌肉萎缩、白血病、贫血、肝功能障碍等。此外，女性妊娠期间也可表现为肌酐的降低。甲状腺功能减退时，可使尿肌酐排泄量增高，从而导致血肌酐降低。
肌酐是肌肉中磷酸肌酸的代谢产物，人体肌肉不断的将肌酐排入血中，因此在剧烈运动后测定肌酐会表现为处于高值，摄入肉类食物过多也会使肌酐升高。肌酐主要从肾小球滤过，其在血液中的浓度取决于肾脏的排泄能力，可以反映肾小球的滤过功能。
